讲题：自动化高精度体电子显微成像重建

讲题介绍：体电子显微镜（vEM）能够在纳米尺度上实现生物组织的三维可视化，是神经科学和细胞生物学研究中的核心技术之一。然而，vEM成像面临数据量大、各向异性分辨率、切片间非线性变形以及成像伪影等多重挑战，对自动化、高精度的三维重建算法提出了迫切需求。在此，我们围绕体电子显微镜三维重建与智能分析，构建了覆盖全流程的自动化算法体系。针对大视野图像拼接，提出vEMstitch及畸变校正方法，实现无缝拼接。针对切片间非线性变形，先后提出高斯滤波快速配准、神经常微分方程无监督轨迹优化，整合为vEMRec软件框架实现结构高保真对齐。针对层间分辨率各向异性，提出vEMINR，利用隐式神经表示实现超快各向同性重建。以上工作覆盖了从预处理、配准重建的完整计算，初步探索了高通量体电子显微分析。

主讲人：韩仁敏

主持人：陈慧灵

时间：2026年4月14日（周二）15:30

地点：计算机与人工智能学院5B318会议室

主讲人简介：

韩仁敏，2016年博士毕业于中国科学院计算技术研究所，2019年底加入山东大学数学与交叉科学研究中心工作至今。韩仁敏围绕计算-生物交叉方向开展了一系列的基础算法研究，研究兴趣主要集中在生物信息学领域中的生物信号、图像处理相关问题，特别包括冷冻电镜三维重构中的相关计算及反问题求解，是国内第一款冷冻电镜电子断层三维重构软件AuTom的主要作者之一，相关工作发表于Nature Communications、Advanced Science、Genome Biology、Fundamental Research、GPB、Bioinformatics等生物信息学领域重要刊物，Structure、JSB、Ultramicroscopy等电子显微学重要刊物，以及NeurIPS、ICCV、AAAI、ACM MM、ISMB/ECCB等人工智能重要会议，主持有国家自然科学基金面上项目、科技部重点研发计划青年科学家项目、山东省优秀青年基金等国家及省部级项目，国家级青年人才，2023年入选山东省泰山学者青年计划。

参加人员

研究生、教师；对计算机、大数据、机器学习等人工智能相关研究感兴趣、对基金申请和写作需要交流的师生。